「E5系はやぶさ」「N700Aのぞみ」など実在する新干线が変形するロボット「シンカリオン」に乗る运転士となった子どもたちが、大人たちと协力して敌に立ち向かう姿を描いたテレビアニメ「新干线変形ロボシンカリオン」の剧场版。次世代新干线开発のための试験车両「ALFA-X」がシンカリオンとして登场し、新たな运転士とともに戦う姿を描く。地球を狙う新たな敌ナハネの出现によって、再び戦いに身を投じることになったハヤトたち「チームシンカリオン」だったが、ナハネの袭撃によってハヤトの父ホクトが行方不明になってしまう。不安を隠せないハヤトの前に、时空を超えて9歳のホクトが现れる。タイムスリップしてきた少年ホクトは、地球を守り、元いた时间に戻るため、最新技术を结集して完成した「シンカリオンALFA-X」の运転士になることを决意する。少年ホクト役は声优の钉宫理恵。ナハネ役で俳优の伊藤健太郎、ナハネの参谋オハネフ役で吉田钢太郎がゲスト出演。