西暦2042年、地球上では突如现れた未知の巨大生物「拟态獣」と、世界各国で开発されていた巨大ロボット达との戦いが缲り広げられていた。日本のスーパーロボット「ゴーダンナー」のパイロット・猿渡ゴオは后に「巨神戦争」と唿ばれるボス拟态獣との决戦において、パートナーであり恋人でもあったミラ・アッカーマンを失ってしまう。だが、ゴオはそれと引き换えに、1人の少女の命を救っていた。その少女の名は、葵杏奈。辛くも人类は戦いに胜利し、5年の歳月が流れた。しかし、世界各地ではまだ拟态獣の亜种が生き残っており、スーパーロボット达との戦いは続いていた。17歳の高校生となった杏奈はゴオと再会して恋に落ち、いつしか2人は结婚を决意する。だが结婚式当日、日本に拟态獣が出现。ゴオは式を途中で中断し、ゴーダンナーで出撃する。しかし、杏奈はただ夫の帰りを待っているだけの女の子ではなかった! 杏奈はゴーダンナーのパートナーロボット「ネオオクサー」に乗り込み、自身も拟态獣との戦いに身を投じる! 果たして、2人は无事结婚することが出来るのか! そして、世界の平和を守ることが出来るのか!