《永远之久远》的故事是讲述因为某些原因，有不少正处于青春期的少男少女突然醒觉了某种能力——他们拥有把他们最渴望的想法化成现实的能力。虽然能够把自己的想法化成现实看似很美好，但当他们滥用新能力时，他们便会给能力侵蚀并失去自我，最后化成怪物“Besutia”。而本作的男主角三槌久远，同様是能力者的他不但没有舍弃他们，并接受了他们的灵魂。在无数的晚上，久远与这些孤独的少男少女们一同生活着。另一方面，神秘的组织“Ordo”派出了机器的猎犬“Custodes”狩猎着久远他们。讽刺的是，这些猎犬也是除了大脑及神经以外，其他部分均换成机器的怪物。异端狩猎着异端的讽刺，谁也逃不过这负面的连锁。就这様，久远和少男少女们与这些Custodes持续战斗着。流着血的久远，也在寻求着明天。